El programa de Doctorado en Economía Aplicada (DEA) con Mención en Estudios Regionales tiene un carácter académico, presencial y exige dedicación exclusiva por parte del estudiante, busca formar doctores de excelencia, capacitados para realizar investigación original que contribuya al desarrollo de las personas y la sociedad y que suponga un avance en la frontera del conocimiento de la Economía Aplicada en el ámbito de los Estudios Regionales.

En el caso del Doctorado, existe un examen de calificación obligatorio cuyo objetivo será evaluar los conocimientos y aptitudes del candidato al grado, en la forma en que determinen los reglamentos respectivos. La aprobación de dicho examen facultará al estudiante para continuar sus estudios y presentar su proyecto de tesis. Comprende además como principal actividad, la realización de un trabajo de investigación que culmina con una tesis, documento escrito individual, que constituye un aporte original, que amplía las fronteras del conocimiento en el ámbito disciplinario del programa. Sin embargo, a consecuencia del tipo de investigación aplicada que se espera desarrollar, los graduados también tendrán la posibilidad de ser demandados por instituciones que realizan el diseño, análisis y aplicación de políticas públicas. En consecuencia, además de la formación investigadora, el programa también entrega altas posibilidades de empleabilidad en el sector público y privado.